martes, 26 de abril de 2022

USA: Los Institutos Nacionales de Salud emiten un mandato sísmico: compartir los datos públicamente

Publicado en Nature
https://www.nature.com/articles/d41586-022-00402-1


Los NIH emiten un mandato sísmico: compartir los datos públicamente

La política de intercambio de datos podría establecer un estándar mundial para la investigación biomédica, dicen los científicos, pero tienen dudas sobre la logística y la equidad.

En enero de 2023, los Institutos Nacionales de la Salud (NIH) de EE.UU. empezarán a exigir a la mayoría de los 300.000 investigadores y 2.500 instituciones que financian anualmente que incluyan un plan de gestión de datos en sus solicitudes de subvención y que, en última instancia, pongan sus datos a disposición del público.

Los investigadores que hablaron con Nature aplauden en gran medida los principios de la ciencia abierta en los que se basa la política y el ejemplo mundial que supone. Pero a algunos les preocupan los problemas logísticos que los investigadores y sus instituciones tendrán que afrontar para cumplirla. En concreto, les preocupa que la política pueda exacerbar las desigualdades existentes en el panorama de la financiación de la ciencia y que pueda ser una carga para los científicos que inician su carrera, que realizan la mayor parte de la recogida de datos y que ya están al límite.

El mandato pretende, en parte, hacer frente a la crisis de reproducibilidad de la investigación científica. El año pasado, un intento de replicar estudios influyentes sobre el cáncer, con un coste de 2 millones de dólares y ocho años de duración, descubrió que menos de la mitad de los experimentos evaluados resistían el escrutinio. Los esfuerzos por contabilizar el coste de la investigación irreproducible en Estados Unidos han revelado que se gastan entre 10.000 y 50.000 millones de dólares en estudios que utilizan métodos deficientes, un coste que en su mayor parte es sufragado por los organismos públicos de financiación.

Los estudios irreproducibles no sólo malgastan el dinero de los contribuyentes, dice Lyric Jorgenson, directora asociada en funciones de la política científica de los NIH, sino que también socavan la confianza del público en la ciencia. "Queremos asegurarnos de que la inversión de la nación se aprovecha y de que se fomenta la transparencia y la responsabilidad en la investigación", afirma.

Joseph Ross, investigador de política sanitaria de la Facultad de Medicina de Yale, en New Haven (Connecticut), afirma que los efectos del mandato se dejarán sentir mucho más allá de las fronteras de EE.UU., ya que los NIH son el mayor financiador público de investigación biomédica del mundo. Es importante asegurarse de que la política establece el tono adecuado, dice Ross, porque señalará a los científicos de todo el mundo cómo debe hacerse la investigación biomédica. 

Un cambio sísmico

Según la nueva política, que entrará en vigor el 25 de enero, todas las solicitudes de subvención de los NIH para proyectos que recojan datos científicos deberán incluir un plan de "gestión y puesta en común de datos" (DMS) que contenga detalles sobre el software o las herramientas necesarias para analizar los datos, cuándo y dónde se publicarán los datos brutos y cualquier consideración especial para acceder a ellos o distribuirlos.

Un cambio tan radical en la práctica ha dejado a algunos investigadores preocupados por la cantidad de trabajo que requerirá el mandato cuando entre en vigor.

Jenna Guthmiller, inmunóloga de la Universidad de Chicago (Illinois), puede dar fe de que probablemente será necesario más trabajo. Ella es una de las pocas investigadoras financiadas a través de un programa del Instituto Nacional de Alergias y Enfermedades Infecciosas (NIAID) de EE.UU. que ha aplicado una política similar al plan de los NIH, dice. Para Guthmiller, eso significó buscar información sobre reactivos y condiciones experimentales que ya no existen desde hace tiempo para un proyecto que lleva cuatro años en marcha. Eso le llevó 15 horas, dice, "y tuve la suerte de trabajar con un gestor de datos". 

Dado que la inmensa mayoría de los laboratorios e instituciones no cuentan con gestores de datos que los organicen y conserven, la política -aunque bien intencionada- probablemente supondrá una pesada carga para los becarios y los investigadores principales que inician su carrera, dice Lynda Coughlan, vacunóloga de la Facultad de Medicina de la Universidad de Maryland en Baltimore, que lleva menos de dos años dirigiendo un equipo de investigación y está preocupada por lo que la política supondrá para ella.

Jorgenson afirma que, aunque la política puede exigir a los investigadores que dediquen más tiempo a la organización de sus datos, es una parte esencial de la investigación, y el posible aumento de la confianza del público en la ciencia a largo plazo justificará el esfuerzo adicional.

A otros les preocupa que las actividades de gestión de datos resten fondos a los laboratorios con pocos recursos. Aunque la política describe ciertas tasas que los investigadores pueden añadir a sus presupuestos propuestos para compensar los costes del cumplimiento del mandato, no especifica qué criterios utilizarán los NIH para conceder estas solicitudes. 

Para que la política tenga éxito, Ross dice que los NIH tienen que ser claros sobre cómo concederán estos recursos -especialmente a los investigadores noveles y a las instituciones con poca financiación- para no exacerbar las desigualdades existentes en la comunidad investigadora.

Jorgenson responde que la agencia está evaluando los costes del cumplimiento y espera preparar más orientaciones e información.


Posibles escollos

Como parte de la política de intercambio de datos, cuando un proyecto de investigación se haya completado o cuando expire su subvención -lo que ocurra primero- los funcionarios del programa de los NIH revisarán el plan de DMS para asegurarse de que los investigadores lo han cumplido. En ese momento, la política estipula que los investigadores deben compartir cualquier "dato científico" necesario para "validar y replicar los hallazgos de la investigación, independientemente de que los datos se utilicen para respaldar las publicaciones académicas", aunque hace una excepción en los casos en los que el intercambio de datos suponga una carga legal, ética o técnica importante. Los NIH recomiendan que estos datos se compartan únicamente en un repositorio acreditado; en última instancia, los investigadores decidirán dónde cargar la información. 

El amplio término "datos científicos" ha dejado a algunos investigadores confundidos sobre qué información exactamente se les pedirá que compartan. Es difícil predecir qué datos pueden ser útiles para otros investigadores, o si alguien podrá acceder a ellos, afirma Coughlan.

En respuesta a un primer borrador de la política, la Asociación Americana de Universidades, una organización con sede en Washington DC que representa a 66 universidades, escribió en 2020 que la definición de datos científicos de los NIH debía ser más precisa, y sugirió que la agencia la limitara para incluir sólo los datos subyacentes a las publicaciones académicas.

Jorgenson afirma que los datos recogidos cuando los experimentos no funcionan -y que, por tanto, no aparecen en las publicaciones- son igualmente importantes de comunicar, porque incluyen información que podría ayudar a otros investigadores a comprender el contexto completo del éxito de un experimento. La ambigüedad de la política ofrece a los investigadores flexibilidad para determinar qué datos son realmente necesarios para reproducir los resultados de la investigación, afirma. 

Brian Nosek, director ejecutivo del Centro para la Ciencia Abierta, con sede en Charlottesville (Virginia), señala que será un gran reto para los NIH asegurarse de que todos los datos relevantes han sido compartidos al final de un proyecto. Aunque la política es un "hito importante en la maduración del movimiento de la ciencia abierta más allá de pensar en el acceso abierto", a Nosek le preocupa que algunos solicitantes no se la tomen en serio si no hay consecuencias por su incumplimiento. Jorgenson responde que si la política no se cumple, podrían ponerse en peligro futuras concesiones de fondos para investigadores o instituciones.

A pesar de sus posibles inconvenientes, Ross cree que la política tendrá un efecto dominó que persuadirá a las agencias de financiación más pequeñas y a la industria a adoptar cambios similares. "Esta política establece lo que la gente espera de la investigación clínica", dice. "Esencialmente está diciendo que la cultura de la investigación tiene que cambiar".

Nature 602, 558-559 (2022)

doi: https://doi.org/10.1038/d41586-022-00402-1 

ACTUALIZACIONES Y CORRECCIONES

Corrección 16 de febrero de 2022: En una versión anterior de este artículo, el apellido de Lyric Jorgenson estaba mal escrito.

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NIH issues a seismic mandate: share data publicly

The data-sharing policy could set a global standard for biomedical research, scientists say, but they have questions about logistics and equity.

In January 2023, the US National Institutes of Health (NIH) will begin requiring most of the 300,000 researchers and 2,500 institutions it funds annually to include a data-management plan in their grant applications — and to eventually make their data publicly available.

Researchers who spoke to Nature largely applaud the open-science principles underlying the policy — and the global example it sets. But some have concerns about the logistical challenges that researchers and their institutions will face in complying with it. Namely, they worry that the policy might exacerbate existing inequities in the science-funding landscape and could be a burden for early-career scientists, who do the lion’s share of data collection and are already stretched thin. 

The mandate, in part, aims to tackle the reproducibility crisis in scientific research. Last year, a US$2-million, eight-year attempt to replicate influential cancer studies found that fewer than half of the assessed experiments stood up to scrutiny. Efforts to tally the cost of irreproducible research in the United States have found that $10 billion to $50 billion is spent on studies that use deficient methods, a cost that is mostly fronted by public funding agencies.

Irreproducible studies not only waste taxpayers’ money, says Lyric Jorgenson, the acting associate director for science policy at the NIH, but also undermine public trust in science. “We want to make sure that we’re making good on the nation’s investment and fostering transparency and accountability in research,” she says.

Joseph Ross, a health-policy researcher at Yale School of Medicine in New Haven, Connecticut, says the mandate’s effects will be felt far beyond US borders because the NIH is the world’s largest public funder of biomedical research. Ensuring that the policy sets the right tone is important, Ross says, because it will signal to scientists all over the world how biomedical research should be done. 

A seismic shift

Under the new policy, which will go into effect on 25 January, all NIH grant applications for projects that collect scientific data must include a ‘data management and sharing’ (DMS) plan that contains details about the software or tools needed to analyse the data, when and where the raw data will be published and any special considerations for accessing or distributing that data.

Such a seismic shift in practice has left some researchers worried about the amount of work that the mandate will require when it becomes effective.

Jenna Guthmiller, an immunologist at the University of Chicago in Illinois, can attest that more work will probably be required. She is one of a handful of researchers funded through a US National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID) programme that has enacted a policy similar to the NIH-wide plan, she says. For Guthmiller, that meant tracking down information on long-gone reagents and experimental conditions for a project that’s been running for four years. That took 15 hours, she says, “and I was fortunate enough to work with a data manager”. 

Because the vast majority of laboratories and institutions don’t have data managers who organize and curate data, the policy — although well-intentioned — will probably put a heavy burden on trainees and early-career principal investigators, says Lynda Coughlan, a vaccinologist at the University of Maryland School of Medicine in Baltimore, who has been leading a research team for fewer than two years and is worried about what the policy will mean for her.

Jorgenson says that, although the policy might require researchers to spend extra time organizing their data, it’s an essential part of conducting research, and the potential long-term boost in public trust for science will justify the extra effort.

Others worry that data-management activities will further sap funds from under-resourced labs. Although the policy outlines certain fees that researchers can add to their proposed budgets to offset the costs of compliance with the mandate, it doesn’t specify what criteria the NIH will use to grant these requests. 

For the policy to be successful, Ross says that the NIH needs to be clear about how it will award these resources — especially to early-career researchers and to underfunded institutions — so as not to exacerbate existing inequities in the research community.

Jorgenson responds that the agency is evaluating the costs of compliance and hopes to prepare more guidance and information.

Potential pitfalls

As part of the data-sharing policy, when a research project is complete or when its grant expires — whichever comes first — NIH programme officers will review the DMS plan to ensure that researchers have adhered to it. At that time, the policy stipulates that researchers must share any ‘scientific data’ needed to “validate and replicate research findings, regardless of whether the data are used to support scholarly publications” — although it makes an exception in cases where data sharing would pose a significant legal, ethical or technical burden. The NIH recommends that this data be shared only in a reputable repository; ultimately, researchers will decide where to upload the information. 

The broad term ‘scientific data’ has left some researchers confused about exactly what information they’ll be required to share. It’s hard to predict which data might be useful for other researchers, or whether that data will ever be accessed by anyone, Coughlan says.

In response to an early draft of the policy, the American Association for Universities, an organization based in Washington DC that represents 66 universities, wrote in 2020 that the NIH’s definition of scientific data needed to be narrowed, and suggested that the agency limit it to include only data underlying scholarly publications.

Jorgenson says that data collected when experiments don’t work — and therefore that are not in publications — are just as important to communicate, because they include information that could help other researchers to understand the full context of an experiment’s success. The ambiguity in the policy offers researchers flexibility in determining which data are truly necessary to reproduce research findings, she says.

Brian Nosek, executive director of the Center for Open Science, based in Charlottesville, Virginia, points out that it will be a major challenge for the NIH to ensure that all relevant data have been shared at the conclusion of a project. Although the policy is an “important milestone of maturing the open-science movement beyond just thinking about open access”, Nosek worries that some applicants might not take it seriously if there are no consequences for non-compliance. Jorgenson responds that if the policy is not followed, future funding awards for researchers or institutions could be jeopardized.

Despite its potential pitfalls, Ross thinks that the policy will have a ripple effect that will persuade smaller funding agencies and industry to adopt similar changes. “This policy establishes what people expect from clinical research,” he says. “It’s essentially saying the culture of research needs to change.”

Nature 602, 558-559 (2022)

doi: https://doi.org/10.1038/d41586-022-00402-1

UPDATES & CORRECTIONS
  • Correction 16 February 2022: In an earlier version of this story, Lyric Jorgenson's surname was spelled incorrectly.

viernes, 22 de abril de 2022

CORE Search: el mayor agregador del mundo de documentos de investigación de acceso abierto rebasa los 200 millones de artículos

Publicado en blog Universo abierto
https://universoabierto.org/2022/03/28/core-search-el-mayor-agregador-del-mundo-de-documentos-de-investigacion-de-acceso-abierto-procedentes-de-repositorios-y-revistas-con-mas-de-200-millones-de-articulos/



CORE Search: el mayor agregador del mundo de documentos de investigación de acceso abierto procedentes de repositorios y revistas con más de 200 millones de artículos

CORE Search

https://core.ac.uk/

CORE es el mayor agregador del mundo de documentos de investigación de acceso abierto procedentes de repositorios y revistas. Es un servicio sin ánimo de lucro prestado por la Open University y Jisc con el objetivo de proporcionar información científica en acceso abierto. La plataforma trabaja con una red mundial de repositorios y revistas aumentando la capacidad de descubrimiento y reutilización de los contenidos de acceso abierto. Proporcionamos soluciones para la gestión de contenidos, el descubrimiento y el acceso automático escalable a la investigación. Sus servicios sirven a una amplia gama de partes interesadas, en concreto a los investigadores, al público en general, a las instituciones académicas, a los desarrolladores, a los financiadores y a las empresas de diversos sectores, entre los que se incluyen, aunque no exclusivamente, los innovadores, las empresas de tecnología de IA, las soluciones de bibliotecas digitales y las farmacéuticas.

CORE acaba de lanzar una importante actualización de su motor de búsqueda, que incluye una nueva y elegante interfaz de usuario y una funcionalidad de búsqueda mejorada. CORE Search es el motor al que acuden los investigadores, bibliotecarios, académicos y demás personas para obtener documentos de investigación de acceso abierto de todo el mundo y para estar al día de la literatura científica más reciente.



jueves, 21 de abril de 2022

USA: mandato "sísmico" por la Ciencia Abierta: datos abiertos obligatorios para los Inst. Nacls. de Salud a partir de 2023

Publicado en The Conversation
https://theconversation.com/new-data-sharing-requirements-from-the-national-institutes-of-health-are-a-big-step-toward-more-open-science-and-potentially-higher-quality-research-178869 


Los nuevos requisitos de intercambio de datos de los Institutos Nacionales de la Salud son un gran paso hacia una ciencia más abierta, y una investigación potencialmente de mayor calidad

Publicado: 24 de marzo de 2022

A partir del 25 de enero de 2023, muchas de las 2.500 instituciones y 300.000 investigadores a los que apoyan los Institutos Nacionales de la Salud de EE.UU. tendrán que presentar un plan formal y detallado para compartir públicamente los datos generados por sus investigaciones. Para muchos miembros de la comunidad científica, esta nueva política de gestión y puesta en común de datos de los NIH parece una obviedad.

El desarrollo increíblemente rápido de pruebas rápidas y vacunas para el COVID-19 demuestra el éxito que puede seguir al intercambio abierto de datos dentro de la comunidad investigadora. La importancia y el impacto de esos datos incluso impulsaron el año pasado una Orden Ejecutiva de la Casa Blanca que ordenaba que "los jefes de todos los departamentos y agencias ejecutivas" compartieran públicamente "los datos relacionados con COVID-19".

Soy el Director de la Oficina de Programas Abiertos del Instituto Tecnológico de Rochester. En Open@RIT, mis colegas y yo trabajamos con el profesorado y los investigadores para ayudarles a compartir abiertamente sus investigaciones y datos de manera que se concedan a otros los derechos de acceso, reutilización y redistribución de ese trabajo con el menor número posible de barreras o restricciones. 

En el ámbito científico, estas prácticas suelen denominarse datos abiertos y ciencia abierta. La revista Nature ha calificado de "sísmico" el impacto de la nueva política de gestión de datos de los NIH, afirmando que podría crear un "estándar global" para el intercambio de datos. Es probable que este tipo de intercambio de datos produzca muchos beneficios para la ciencia, pero también hay algunas preocupaciones sobre cómo los investigadores cumplirán los nuevos requisitos.

Qué compartir y cómo compartirlo

La nueva política de los NIH en materia de intercambio de datos sustituye a un mandato de 2003. Aun así, para algunos científicos, la nueva política supondrá un gran cambio. El Dr. Francis S. Collins, entonces director de los NIH, dijo en la declaración de 2020 en la que se anunciaban los próximos cambios de política que el objetivo es "cambiar la cultura de la investigación" para que el intercambio de datos sea la norma, y no la excepción. 

En concreto, la política exige dos cosas. En primer lugar, que los investigadores compartan todos los datos científicos que otros equipos necesitarían para "validar y replicar" los resultados de la investigación original. Y en segundo lugar, que los investigadores incluyan un plan de gestión de datos de dos páginas como parte de su solicitud de cualquier financiación de los NIH.

¿Qué es exactamente un plan de gestión de datos? Tomemos un estudio imaginario sobre las olas de calor y los golpes de calor, por ejemplo. Todos los buenos investigadores recogerían mediciones de la temperatura, la humedad, la época del año, los mapas meteorológicos, los atributos de salud de los participantes y muchos otros datos.

A partir del año que viene, los equipos de investigación tendrán que haber determinado qué datos fiables utilizarán, cómo se almacenarán los datos, cuándo podrán acceder a ellos otras personas, si se necesitará o no un software especial para leer los datos, dónde encontrar ese software y muchos otros detalles, todo ello incluso antes de que comience la investigación, de modo que estas cosas puedan incluirse en el plan de gestión de datos de la propuesta.

Además, los investigadores que soliciten financiación de los NIH tendrán que asegurarse de que sus datos estén disponibles y se almacenen de forma que persistan mucho después de que el proyecto inicial haya terminado.

Los NIH han declarado que apoyarán -con financiación adicional- los costes relacionados con la recogida, el intercambio y el almacenamiento de datos.


Compartir datos promueve la ciencia abierta

Los NIH argumentan que la nueva política será "buena para la ciencia" porque maximiza la disponibilidad de los datos para otros investigadores, aborda los problemas de reproducibilidad, conduce a una mejor protección y uso de los datos y aumenta la transparencia para garantizar la confianza pública y la responsabilidad. 

El primer gran cambio de la nueva política -compartir específicamente los datos necesarios para validar y replicar- parece dirigido a la proliferación de investigaciones que no pueden reproducirse. Podría decirse que si se garantiza la disponibilidad de todos los datos relevantes de un experimento determinado, el mundo científico podría evaluar y validar mediante réplicas la calidad de la investigación con mucha más facilidad.

Creo firmemente que la exigencia de planes de gestión y compartición de datos aborda un gran reto de la ciencia abierta: poder encontrar rápidamente los datos adecuados, así como acceder a ellos y aplicarlos. Los NIH dicen, y yo estoy de acuerdo, que la exigencia de planes de gestión de datos ayudará a que el uso de los datos abiertos sea más rápido y eficiente. Desde el Proyecto Genoma Humano en la década de 1990 hasta el reciente y rápido desarrollo de pruebas y vacunas para el COVID-19, los beneficios de una mayor apertura en la ciencia han quedado demostrados. 


¿Serán los nuevos requisitos una carga?

En el fondo, el objetivo de la nueva política es hacer la ciencia más abierta y luchar contra la mala ciencia. Pero por muy beneficiosa que sea la nueva política, no está exenta de costes y carencias.

En primer lugar, replicar un estudio -incluso cuando los datos ya están disponibles- sigue consumiendo costosos recursos humanos, informáticos y materiales. El sistema científico no recompensa tanto a los investigadores que reproducen los resultados de un experimento como a los que lo originan. Creo que la nueva política mejorará algunos aspectos de la reproducción, pero sólo abordará algunos eslabones de la cadena general.

En segundo lugar, preocupa el aumento de la carga de trabajo y los retos financieros que implica el cumplimiento de los requisitos. Muchos científicos no están acostumbrados a preparar un plan detallado de lo que van a recoger y cómo lo van a compartir como parte de la solicitud de financiación. Esto significa que pueden necesitar formación para ellos mismos o el apoyo de personal capacitado para hacerlo. 


Parte de una tendencia mundial hacia la ciencia abierta

Los NIH no son la única agencia federal que busca más datos y ciencia abiertos. En 2013, la administración Obama ordenó que todas las agencias con un presupuesto de 100 millones de dólares o más debían proporcionar acceso abierto a sus publicaciones y datos. La National Science Foundation publicó su primera política de datos abiertos dos años antes. Muchos miembros de la Unión Europea están elaborando políticas nacionales sobre ciencia abierta, sobre todo Francia, que ya ha publicado la segunda.

El cambio cultural en la ciencia que el director de los NIH, Collins, mencionó en 2020 ha estado ocurriendo, pero para muchos, como yo, que apoyan estos esfuerzos, el progreso ha sido dolorosamente lento. Espero que la nueva política de datos abiertos de los NIH ayude a que este movimiento cobre impulso.


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New data-sharing requirements from the National Institutes of Health are a big step toward more open science – and potentially higher-quality research

Published: March 24, 2022


Starting on Jan. 25, 2023, many of the 2,500 institutions and 300,000 researchers that the U.S. National Institutes of Health supports will need to provide a formal, detailed plan for publicly sharing the data generated by their research. For many in the scientific community, this new NIH Data Management and Sharing Policy sounds like a no-brainer.

The incredibly quick development of rapid tests and vaccines for COVID-19 demonstrate the success that can follow the open sharing of data within the research community. The importance and impact of that data even drove a White House Executive Order mandating that “the heads of all executive departments and agencies” share “COVID-19-related data” publicly last year. 

I am the Director of the Rochester Institute of Technology’s Open Programs Office. At Open@RIT, my colleagues and I work with faculty and researchers to help them openly share their research and data in a manner that provides others the rights to access, reuse and redistribute that work with as few barriers or restrictions a possible. In the sciences, these practices are often referred to as open data and open science.

The journal Nature has called the impact of the NIH’s new data management policy “seismic,” saying that it could potentially create a “global standard” for data sharing. This type of data sharing is likely to produce many benefits to science, but there also are some concerns over how researchers will meet the new requirements.

What to share and how to share it

The NIH’s new policy around data sharing replaces a mandate from 2003. Even so, for some scientists, the new policy will be a big change. Dr. Francis S. Collins, then Director of the NIH, said in the 2020 statement announcing the coming policy changes that the goal is to “shift the culture of research” so that data sharing is the norm, rather than the exception. 

Specifically, the policy requires two things. First, that researchers share all the scientific data that other teams would need in order to “validate and replicate” the original research findings. And second, that researchers include a two-page data management plan as part of their application for any NIH funding.

So what exactly is a data management plan? Take an imaginary study on heat waves and heatstroke, for example. All good researchers would collect measurements of temperature, humidity, time of year, weather maps, the health attributes of the participants and a lot of other data.

Starting next year, research teams will need to have determined what reliable data they will use, how the data will be stored, when others would be able to get access to it, whether or not special software would be needed to read the data, where to find that software and many other details – all before the research even begins so that these things can be included in the proposal’s data management plan. 

Additionally, researchers applying for NIH funding will need to ensure that their data is available and stored in a way that persists long after the initial project is over.

The NIH has stated that it will support – with additional funding – the costs related to the collection, sharing and storing of data.

Sharing data promotes open science

The NIH’s case for the new policy is that it will be “good for science” because it maximizes availability of data for other researchers, addresses problems of reproducibility, will lead to better protection and use of data and increase transparency to ensure public trust and accountability. 

The first big change in the new policy – to specifically share the data needed to validate and replicate – seems aimed at the proliferation of research that can’t be reproduced. Arguably, by ensuring that all of the relevant data from a given experiment is available, the scientific world would be better able to evaluate and validate through replication the quality of research much more easily.

I strongly believe that requiring data-sharing and management plans addresses a big challenge of open science: being able to quickly find the right data, as well as access, and apply it. The NIH says, and I agree, that the requirement for data management plans will help make the use of open data faster and more efficient. From the Human Genome Project in the 1990s to the recent, rapid development of tests and vaccines for COVID-19, the benefits of greater openness in science have been borne out. 

Will the new requirements be a burden?

At its core, the goal of the new policy is to make science more open and to fight bad science. But as beneficial as the new policy is likely to be, it’s not without costs and shortfalls.

First, replicating a study – even one where the data is already available – still consumes expensive human, computing and material resources. The system of science doesn’t reward the researchers who reproduce an experiment’s results as highly as the ones who originate it. I believe the new policy will improve some aspects of replication, but will only address a few links in the overall chain.

Second are concerns about the increased workload and financial challenges involved in meeting the requirements. Many scientists aren’t used to preparing a detailed plan of what they will collect and how they will share it as a part of asking for funding. This means they may need training for themselves or the support of trained staff to do so. 

Part of a global trend toward open science

The NIH isn’t the only federal agency pursuing more open data and science. In 2013, the Obama administration mandated that all agencies with a budget of $100 million or more must provide open access to their publications and data. The National Science Foundation published their first open data policy two years earlier. Many European Union members are crafting national policies on open science – most notably France, which has already published it’s second.

The cultural shift in science that NIH Director Collins mentioned in 2020 has been happening – but for many, like me, who support these efforts, the progress has been painfully slow. I hope that the new NIH open data policy will help this movement gain momentum.

REPORTE: Informe sobre la madurez de los datos abiertos

Publicado en blog Universo abierto
https://universoabierto.org/2022/03/17/informe-sobre-la-madurez-de-los-datos-abiertos/

Informe sobre la madurez de los datos abiertos

Hesteren, D., Knippenberg, L., Weyzen, R., et al., Open data maturity report Publications Office,2021, 2022

Texto completo



La evaluación de la madurez de los datos abiertos en 2021 evalúa el desarrollo de los países europeos en el ámbito de los datos abiertos. Se trata del séptimo informe anual consecutivo de data.europa.eu (anteriormente realizado por el Portal Europeo de Datos). El objetivo de este informe es ayudar a los países a comprender mejor su nivel de madurez, captar su progreso a lo largo del tiempo, encontrar áreas de mejora y compararlo con otros países. Además, el estudio ofrece una visión general de las mejores prácticas aplicadas en toda Europa que podrían transferirse a otros contextos nacionales y locales. La evaluación mide la madurez con respecto a cuatro dimensiones de los datos abiertos: Política: se centra en las políticas y estrategias de datos abiertos de los países Impacto: examina las actividades para supervisar y medir la reutilización de los datos abiertos Portal: evalúa las funciones y características del portal que permiten a los usuarios acceder a los datos abiertos a través del portal nacional y apoyan la interacción dentro de la comunidad de datos abiertos Calidad: se centra en los mecanismos que garantizan la calidad de los (meta)datos A continuación se destacan tres tendencias encontradas durante la evaluación: la transposición de la Directiva de Datos Abiertos a la legislación nacional, el enfoque más prominente en la medición del impacto de los datos abiertos y la continua creación de valor de la pandemia COVID-19. A continuación, se resume la clasificación general, la agrupación de países y la evolución por dimensión.

lunes, 18 de abril de 2022

REINO UNIDO: ¿acepta financiar APCs de € 9,500 / US$ 11,390 por publicación en acceso abierto en Nature?

Publicado en THE Times Higher Education
https://www.timeshighereducation.com/news/late-reprieve-allows-scientists-uk-grants-publish-nature?utm_source=newsletter&utm_medium=email&utm_campaign=editorial-daily&mc_cid=5c589755b8&mc_eid=d622713526 


Un indulto tardío permite a los científicos con becas del Reino Unido publicar en Nature

El acuerdo temporal llega el día de la nueva política de acceso abierto del Reino Unido, pero plantea el problema de pagar un alto precio por el "viaje del ego" de la publicación en Nature

8 de abril de 2022

Jack Grove
Twitter: @jgro_the

Los académicos subvencionados por los consejos de investigación del Reino Unido no tendrán prohibido utilizar dinero público para publicar en Nature, después de que se llegara a un acuerdo de última hora para permitirles publicar en acceso abierto en el prestigioso título.

A partir de este mes, el Consejo de Investigación e Innovación del Reino Unido (UKRI) sólo permitirá que sus fondos paguen por la publicación en acceso abierto de títulos que cumplan su definición de "revista transformadora". Mientras que Springer Nature, propietaria de Nature, se ha comprometido a convertir la mayoría de sus publicaciones en acceso abierto, Nature y otros títulos no cumplían la definición de UKRI de revistas transformadoras y fueron excluidos de una lista de revistas aprobada por Jisc.

Después de meses de incertidumbre sobre si Nature quedaría fuera del alcance de miles de investigadores británicos, que habrían tenido que recurrir a otros fondos ajenos al UKRI para financiar las tasas de publicación, la situación se ha resuelto finalmente tras anunciarse un acuerdo temporal el día en que entró en vigor la nueva política de acceso abierto del UKRI.

En un comunicado enviado a las universidades el 1 de abril, Nick Campbell, vicepresidente (asuntos académicos) de Nature Portfolio y Springer Nature, dijo que quería dejar "claro que la publicación en Acceso Abierto (AA) en cualquier revista de Nature cumple con la nueva política de AA del UKRI".

"La política se aplica a las presentaciones a partir de hoy y la medida provisional que hemos acordado con Jisc significa que cualquier artículo relevante que sus investigadores publiquen en estas revistas puede utilizar los fondos de AA de UKRI para pagar el APC [cargo por procesamiento de artículos]".

Nature anunció que cobraría a los autores 8.290 libras esterlinas (9.500 euros o 11.390 dólares) para que sus trabajos fueran de libre acceso.

El Dr. Campbell añadió que el acuerdo temporal duraría lo que queda de 2022 y que Springer Nature espera "que a partir de enero de 2023 esté en vigor un acuerdo transformador con Jisc, que sustituirá a la medida provisional que hemos acordado".

Es probable que el acuerdo a corto plazo centre la atención en la medida en que Springer Nature pueda estar dispuesta a reducir su APC de Nature en cualquier acuerdo futuro o si los investigadores del Reino Unido están dispuestos a aceptar no publicar en Nature, una de las publicaciones científicas más citadas y prestigiosas del mundo.

David Price, vicerrector de investigación de la UCL, afirmó que "no le preocupa en absoluto" que los investigadores británicos no aparezcan en Nature. "Publicar en Nature es un viaje de ego para muchos investigadores; yo mismo he publicado antes, pero es una revista muy idiosincrásica y publicar en ella no es garantía de calidad", añadió.

El actual APC de Nature es "imperdonable", continuó el profesor Price, quien dijo que creía que Springer Nature "se alinearía" en el tema de los costes en el acceso abierto.

En un comunicado, Springer Nature dijo que "comparte los objetivos de UKRI y Jisc de permitir una transición completa hacia el AA inmediato para la investigación primaria". 

La "falta de un mecanismo de financiación formalmente acordado" para Nature y otros títulos había sido "preocupante para los autores potenciales y, por lo tanto, en reconocimiento de nuestro deseo de poner en marcha un acuerdo transformador con las instituciones del Reino Unido, Springer Nature garantizará una ruta de cumplimiento de la publicación para los autores correspondientes financiados por el UKRI que se presenten a estos títulos desde el 1 de abril hasta el 31 de diciembre de 2022, lo que nos permite registrarlos como revistas transformadoras aprobadas por Jisc", agregó.

"Como resultado, estos autores podrán publicar de acuerdo con la política de UKRI e incluso podrán utilizar los fondos disponibles si lo desean para que la versión final publicada esté disponible de inmediato".

En la práctica, significaría que "para los envíos realizados durante este período, los autores correspondientes financiados por el UKRI podrán autoarchivar su manuscrito aceptado en línea con la política de AA del UKRI", añadió, que permitió a Nature y otros títulos "cumplir con los requisitos del JISC para las revistas transformadoras" y que "los autores también podrán acceder a los fondos del UKRI para apoyar el APC para publicar el [oro] AA".

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Late reprieve allows scientists with UK grants to publish in Nature

Temporary deal arrives on day of UK’s new open access policy, but raises issue of paying high price for ‘ego trip’ of Nature publication

April 8, 2022

Jack Grove
Twitter: @jgro_the

Academics supported by UK research council grants will not be barred from using public money to publish in Nature after a last-minute deal was struck to allow them to publish open access in the prestigious title.

From this month, UK Research and Innovation (UKRI) will only allow its funding to pay for open access publishing in titles that meet its definition of being a “transformative journal”. While Nature owner Springer Nature has committed to transitioning the majority of its imprints to open access, Nature and several other titles did not meet UKRI’s definition of transformative journals and were excluded from a Jisc-approved list of journals

After months of uncertainty about whether Nature would be off limits to thousands of UK researchers, who would have needed to source other non-UKRI funds to finance publication fees, the situation has finally been resolved after a temporary deal was announced on the day that UKRI’s new open access policy took effect.

In a statement sent to universities on 1 April, Nick Campbell, vice-president (academic affairs) at Nature Portfolio and Springer Nature, said that he wanted to make it “clear that publishing OA in any Nature journal is compliant with the new UKRI OA policy”.

“The policy applies to submissions from today and the interim measure we’ve agreed with Jisc means that any relevant paper that your researchers publish in these journals can use UKRI OA funds to pay the APC [article processing charge].” 

Nature announced that it would charge authors £8,290 (€9,500 or $11,390) to make their work free to read.

Dr Campbell added that the temporary deal would last for the remainder of 2022 and that Springer Nature expects “that a transformative agreement  with Jisc will be in place from January 2023, which will replace the interim measure that we’ve agreed”.

The short-term deal is likely to focus attention on how far Springer Nature may be willing to lower its Nature APC in any future deal or whether UK researchers are willing to accept not publishing in Nature – one of the world’s most highly cited and prestigious science titles. 

David Price, vice-provost (research) at UCL, said he was “not concerned at all” that UK researchers might not feature in Nature. “Publishing in Nature is an ego trip for a lot of researchers – I’ve published myself before but it’s a very idiosyncratic journal and publishing in it isn’t a guarantee of quality,” he added.

The current Nature APC is “unforgivable”, continued Professor Price, who said he believed that Springer Nature would “fall into line” on the issue of costs in open access.

In a statement, Springer Nature said it “shares UKRI and Jisc’s goals of enabling a full transition to immediate OA for primary research”.  

The “lack of a formally agreed funding mechanism” for Nature and other titles had been “concerning for potential authors and so, in recognition of our desire to put in place a transformative agreement with UK institutions, Springer Nature will guarantee a compliant route to publication for UKRI-funded corresponding authors submitting to these titles from 1st April until 31st December 2022, enabling us to register them as Jisc-approved transformative journals," it added.

“As a result, these authors will be able to publish in compliance with UKRI policy and may even use available funds if desired to make the final published version immediately available."

In practice, it would mean that "for submissions made during this period, UKRI funded corresponding authors will be able to self-archive their accepted manuscript in line with UKRI OA policy," it added, which alllowed Nature and other titles to "meet the JISC requirements for transformative journals" and that  "authors will also be able to access UKRI funds to support the APC to publish the [gold] OA."

jack.grove@timeshighereducation.com


Vetado el uso en Rusia de Times New Roman, Arial, Verdana y otras fuentes, por culpa de las sanciones (no, no son software libre)

Publicado en Genbeta
https://www.genbeta.com/actualidad/vetado-uso-rusia-times-new-roman-arial-verdana-otras-fuentes-culpa-sanciones-no-no-software-libre




Vetado el uso en Rusia de Times New Roman, Arial, Verdana y otras fuentes, por culpa de las sanciones (no, no son software libre)

La mayoría de equipos informáticos del mundo, sean Windows, Mac o Linux, incluyen un 'paquete básico' de tipografías preinstaladas, que a todos nos sonarán: Times New Roman, Arial, Helvetica, Verdana, Tahoma… tipografías que la mayoría de los usuarios cree que son 'open source' o de dominio público. Pero no es así.

Microsoft las incorporó —junto a varias fuentes propias, como la infame Comic Sans— a su sistema operativo Windows en 1996, como un paquete de software llamado 'Core fonts to the Web', con el objetivo de que fueran usadas por los diseñadores web, y de poder mostrarlas en su navegador Internet Explorer.

El proyecto finalizó en 2002, aunque sigue siendo posible usar los archivos TrueType distribuidos hasta ese momento (pero no las versiones actualizadas, lanzadas durante los últimos 20 años) y sólo en proyectos sin ánimo de lucro. ¿Y dónde se pueden adquirir esas versiones actualizadas y compatibles con proyectos comerciales, algo vital para editoriales y para agencias de publicidad y diseño?

Lo sentimos, Alexei, no puede usted comprar Times New Roman

Fácil: en la web de su empresa propietaria original, Monotype Imaging, una empresa con sede en los Estados Unidos y, por desgracia para los usuarios rusos, sometida a la legislación que obliga a aplicar las sanciones comerciales occidentales contra su país en respuesta a la guerra en Ucrania…

…de modo que, como mínimo desde el pasado 11 de abril, cuando los usuarios rusos intentan acceder a la biblioteca de fuentes de la web de Monotype para adquirir una licencia de uso de alguna de las 36.000 tipografías de su catálogo (incluyendo las antes citadas, las más usadas del mundo), sólo reciben un mensaje que les comunica que

"El propietario del sitio puede haber establecido restricciones que le impiden acceder al mismo".

Poco después de hacerse esto público, un portavoz de Monotype lo confirmó realizando las siguientes declaraciones a la agencia de noticias rusa TASS:

"Lamento decir que, teniendo en cuenta las circunstancias actuales de las sanciones y las relaciones internacionales con Rusia, en la actualidad no podemos mantener relaciones comerciales con empresas rusas o sus filiales. Continuaremos vigilando la situación y actualizando nuestra política en consecuencia".

Times New Roman, Helvetica y compañía cuentan con soporte para el alfabeto cirílico, usado al escribir en ruso

Hace 8 años, después de la anexión rusa de Crimea y del apoyo de Moscú a la independencia de las repúblicas del Donbás, Monotype ya retiró su permiso de uso de sus fuentes a varias organizaciones rusas, incluidas las compañías tecnológicas que desarrollan software para su Ministerio de Defensa.

¿Tienen alternativa los rusos?

The Moscow Times cita palabras de Alexei Andreyev, socio gerente de la agencia de branding Depot, en la que afirma que "el mundo no gira en torno a Monotype: muchas otras plataformas ofrecen fuentes similares".

Sin ir más lejos, el paquete de fuentes GPL 'Liberation' constituye una alternativa a las 'Core fonts' que se incluye preinstalada en varias distribuciones de Linux, con Liberation Sans como alternativa a Arial y Liberation Serif como alternativa a Times New Roman.

Si, por el contrario, no encuentran aceptables estas alternativas, aún tienen dos opciones:

miércoles, 13 de abril de 2022

USA: biblioteca de Nueva York pondrá libros prohibidos a disposición de lectores

Publicado en La Jornada San Luis
https://lajornadasanluis.com.mx/internacional/biblioteca-de-ny-pondra-libros-prohibidos-a-disposicion-de-lectores/



Biblioteca de NY pondrá libros prohibidos a disposición de lectores                                          

13 abril, 2022

David Brooks, corresponsal

Nueva York. La Biblioteca Pública de Nueva York, el sistema de bibliotecas más grande del país, anunció que hará disponible a todos los lectores del país, sean usuarios o no, una selección de libros frecuentemente prohibidos o censurados como respuesta a la ola de esfuerzos para prohibir libros por fuerzas conservadoras alrededor del país.

“La misión de la Biblioteca Pública de Nueva York (NYPL) está basada en los principios de libre y abierto acceso al conocimiento, información y todas las perspectivas, en esencia, el derecho a leer”, escribió Anthony Marx, presidente de esta red bibliotecaria de 92 sucursales por toda la cuidad fundada en 1895 con su icónica sede principal en el famoso edificio en la Quinta Avenida, cuya entrada está velada por dos leones de mármol.

“El conocimiento es poder; la ignorancia es peligrosa, cultivando odio y división. Todos tienen el derecho a leer o no leer lo que quieran, todos tenemos el derecho de tomar esas decisiones”, subrayó.

“A la luz de esfuerzos recientes y prominentes para prohibir libros en comunidades a través de Estados Unidos”, la NYPL, en asociación con tres editoriales, ofrecerá en versión cibernética una selección de obras que están entre las más censuradas, a cualquiera que ingrese a su app para lectura [https://www.nypl.org/spotlight/books-for-all].

“Los esfuerzos recientes, algunos intentados otros exitosos, de prohibición de libros -principalmente sobre títulos que exploran raza, temas de LGBTQ, religión e historia- son extremamente preocupantes y llegan a ser un ataque total contra el fundamento de nuestra democracia”, continúa la declaración de Marx.

Señala que la Asociación Americana de Bibliotecas (ALA) recién registró un número sin precedente de intentos de censura de materiales en bibliotecas, escuelas y universidades durante 2021. Como reportó anteriormente La Jornada, ALA registró 729 intentos para prohibir mil 597 títulos en iniciativas locales y estatales alrededor del país.

“Desde su inicio, las bibliotecas públicas han luchado contra estas fuerzas sencillamente al hacer accesible todas las perspectivas e ideas a todos, sin importar sus antecedentes o circunstancias”, afirmó, concluyendo que “el papel de la Biblioteca es asegurar que ninguna perspectiva, ninguna idea sea borrada”.

La NYPL ofrece servicios gratuitos a más de 16 millones de personas cada año, y millones más a través de su ciberespacio, y contiene más de 56 millones de libros, documentos, videos y más, incluyendo una de las pocas copias de la Biblia de Gutenberg, un borrador de la Declaración de Independencia y cartas y manuscritos originales de Shakespeare, Charles Dickens, Virginia Woolf y John Coltrane.

La ALA y otras agrupaciones como PEN America han sonado la alarma sobre los peligros de una campaña bien coordinada y financiada de organizaciones derechistas que han multiplicado sus intentos para prohibir libros en decenas de distritos escolares en unos 26 estados, como a nivel estatal con el apoyo de gobernadores en Texas, Florida y Virginia entre otros.

Ahora los bibliotecarios se convierten en algunos de los principales defensores de esta democracia [https://www.jornada.com.mx/2022/03/26/mundo/020n1mun]



Una herramienta de Google permite detectar fácilmente la escritura generada por IA

Publicado en blog  Universo abierto https://universoabierto.org/2024/10/25/una-herramienta-de-google-permite-detectar-facilmente-la-escritur...