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viernes, 3 de mayo de 2024

Declaración de Barcelona, OpenAlex y las bases de datos propietarias

Publicado en Science

https://www.science.org/content/article/researchers-need-open-bibliographic-databases-new-declaration-says 


Los investigadores necesitan bases de datos bibliográficas "abiertas", según una nueva declaración

Las principales plataformas, como Web of Science, ampliamente utilizadas para generar métricas y evaluar a los investigadores, están protegidas por derechos de propiedad intelectual.


16 ABR 2024

POR CATHERINE OFFORD


Cuando las universidades deciden a quién contratan y promocionan, o las organizaciones que conceden subvenciones seleccionan los proyectos que financiarán, es muy probable que consulten algo más que los materiales de solicitud. Muchas organizaciones se basan en bases de datos que recopilan información sobre publicaciones, incluidos autores, afiliaciones, citas y fuentes de financiación, para crear métricas destinadas a cuantificar la productividad de un investigador y la calidad de su trabajo.


Algunas de las bases de datos más conocidas, como Web of Science y Scopus, son privadas y ofrecen datos y servicios de acceso de pago en apoyo de estas y otras métricas, como las clasificaciones universitarias y los factores de impacto de las revistas. Pero en una declaración publicada hoy (declaration posted today), más de 30 organizaciones de investigación y financiación piden a la comunidad que se comprometa con plataformas que, en cambio, sean gratuitas para todos, más transparentes sobre sus métodos y sin restricciones sobre cómo pueden utilizarse los datos.


La Universidad de la Sorbona, que suspendió su suscripción a Web of Science el año pasado y se pasó a una plataforma más nueva y abierta llamada OpenAlex (which discontinued its subscription to the Web of Science last year and switched to a newer, open platform called OpenAlex), afirmó en un comunicado que "con la firma de la Declaración, queremos demostrar que no sólo este avance hacia la información de investigación abierta debe ser un objetivo, sino que puede hacerse". La medida podría ayudar a remediar el hecho de que las bases de datos existentes se centren en las revistas en lengua inglesa, afirman sus defensores. También podría ayudar a mejorar "la circulación del conocimiento científico y local producido en diferentes idiomas, formatos y regiones geográficas", afirma otro de los firmantes, el Consejo Latinoamericano de Ciencias Sociales a través del Foro Latinoamericano de Evaluación Científica.


La declaración es un "avance excelente", afirma Elizabeth Gadd, experta en comunicaciones académicas y responsable de cultura y evaluación de la investigación y la innovación de la Universidad de Loughborough, que no participó en su elaboración. "Muchas organizaciones se han comprometido públicamente con las prácticas de investigación abierta, pero siguen utilizando fuentes de datos bibliográficos cerradas y comerciales para el análisis de la investigación". El anuncio debería "espolear a un mayor número de organizaciones a 'poner su dinero donde está su boca'".


Para ello, los partidarios de la declaración esperan crear una Coalición para la Información Abierta sobre Investigación con el fin de planificar los próximos pasos, afirma la coordinadora Bianca Kramer, experta en comunicaciones académicas de la consultora Sesame Open Science. "Queremos facilitar que las organizaciones trabajen en esa transición, entre otras cosas aprovechando la experiencia de los demás y explorando la acción colectiva".


Crear y mantener una base de datos de información sobre investigación no es tarea fácil. Aunque los algoritmos informáticos pueden recopilar muchos datos de forma automática, los propietarios de las bases de datos tienen además que corregir errores y completar la información que falta, así como proporcionar capacidades de búsqueda y herramientas analíticas que permitan a los usuarios navegar por estos vastos recursos.


Entre las alternativas existentes a las bases de datos patentadas se encuentran PubMed, Crossref, OpenCitations y OpenAlex. La última de ellas, creada en 2022 por la organización sin ánimo de lucro OurResearch con financiación de la organización benéfica Arcadia Fund del Reino Unido, ha recibido recientemente el apoyo de personalidades destacadas y se ha asociado con organizaciones como el Ministerio de Enseñanza Superior e Investigación de Francia.


Pero a algunos expertos les preocupa su calidad en comparación con las bases de datos patentadas en esta fase. En un análisis reciente (recent analysis), Frédérique Bordignon, investigadora en bibliometría de la Escuela de Puentes ParisTech, descubrió que una gran parte de los miles de artículos devueltos por OpenAlex para su institución estaban asignados incorrectamente. Los errores incluían confundir ponencias de congresos con artículos académicos y confundir nombres de instituciones. Bases de datos comerciales como Web of Science tenían algunos de estos problemas al principio, pero han eliminado muchos gracias a las correcciones aportadas por las instituciones, un trabajo que habría que repetir con las nuevas bases de datos.  


Jason Portenoy, ingeniero de datos sénior de OurResearch, reconoce la necesidad de contar con la opinión de la comunidad y afirma que es comprensible que las instituciones se resistan a volver a realizar el trabajo. «Pero la diferencia es que con OpenAlex se hace abiertamente», afirma. Jason Priem, Director General de OurResearch, añade que las lagunas en la calidad de los datos se están cerrando rápidamente. «OpenAlex evoluciona muy deprisa, y a menudo los problemas descubiertos por nuestra comunidad se solucionan en pocos meses». Cuando uno de los coordinadores de la declaración -Ludo Waltman, director científico del Centro de Estudios de Ciencia y Tecnología de la Universidad de Leiden- y sus colegas utilizaron recientemente OpenAlex para clasificar más de 1.400 universidades de todo el mundo (used OpenAlex to rank more than 1400 universities worldwide), llegaron a la conclusión de que, aunque necesita mejoras, el método arrojaba una «calidad de datos sorprendentemente buena» (“surprisingly good data quality.”).


Clarivate, que gestiona la Web of Science y ayudó a financiar el predecesor de OurResearch, ImpactStory, «apoya ampliamente los objetivos de esta declaración», afirma Emmanuel Thiveaud, Vicepresidente Senior de Investigación y Análisis para la Academia y el Gobierno. «Sin embargo, creemos que hay espacio y necesidad para múltiples perspectivas. ... Ningún enfoque único ni ninguna entidad podría abordar los retos más acuciantes a los que se enfrenta la investigación». Elsevier, que gestiona Scopus, afirma que apoya desde hace tiempo las iniciativas abiertas y da la bienvenida a «cualquier proyecto que apoye la investigación, ya que compartimos el mismo objetivo.» 


Las bases de datos comerciales pueden seguir aportando valor en este nuevo panorama, afirma Waltman. Pero, «en lugar de monetizar sus datos, [podrían] cambiar a una nueva forma de trabajar en la que sus datos sean abiertos y los usuarios, en cambio, paguen por servicios sobre los datos». 


Daniel Hook, Director General de Digital Science, que explota la base de datos patentada Dimensions, ve con buenos ojos esta idea. (Dimensions ya ofrece una versión gratuita para uso no comercial, aunque los usuarios tienen que suscribirse para acceder a todas las funciones). Aun así, esta transición llevará tiempo, afirma Hook. Las bases de datos propietarias tienen que recuperar los costes de creación, mejora y mantenimiento de conjuntos de datos tan grandes, un reto al que también podrían enfrentarse a largo plazo equivalentes abiertas como OpenAlex.



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Researchers need ‘open’ bibliographic databases, new declaration saysMajor platforms such as the Web of Science, widely used to generate metrics and evaluate researchers, are proprietary


When universities are deciding whom to hire and promote, or grant organizations are selecting projects to fund, there’s a good chance they’re referencing more than just the application materials. Many organizations rely on databases that compile publication information including authors, affiliations, citations, and funding sources to create metrics meant to quantify a researcher’s productivity and the quality of their work.

Some of the best known databases, such as the Web of Science and Scopus, are proprietary and offer pay-to-access data and services supporting these and other metrics, including university rankings and journal impact factors. But in a declaration posted today, more than 30 research and funding organizations call for the community to commit to platforms that instead are free for all, more transparent about their methods, and without restrictions about how the data can be used.

“At a time when decision making in science is increasingly guided by indicators and analytics, addressing the problems of closed research information must be a top priority,” states the Barcelona Declaration on Open Research Information. Signatories so far include funders such as the Bill & Melinda Gates Foundation and the French National Research Agency, as well as more than a dozen academic institutions. 

Sorbonne University—which discontinued its subscription to the Web of Science last year and switched to a newer, open platform called OpenAlex—said in a statement that “by signing the Declaration, we want to show that not only this move towards open research information should be an objective, but that it can be done.” The move may help remediate existing databases’ focus on English-language journals, advocates say. It could also help improve “circulation of scientific and local knowledge produced in different languages, formats, and in different geographic regions,” says another signatory, the Latin American Council of Social Sciences through the Latin American Forum for Scientific Evaluation.

The declaration is an “excellent development,” says Elizabeth Gadd, a scholarly communications expert and head of research and innovation culture and assessment at Loughborough University who was not involved in preparing it. “Many organizations have made public commitments to open research practices but continue to use closed and commercial bibliographic data sources for research analytics.” The announcement should “spur a wider range of organizations to ‘put their money where their mouth is.’” 

To that end, the declaration’s supporters hope to establish a Coalition for Open Research Information to plan next steps, says coordinator Bianca Kramer, a scholarly communications expert with consultancy Sesame Open Science. “We want to make it easier for organizations to work towards that transition, among other things by benefiting from each other’s expertise and by exploring collective action.”

Establishing and maintaining a research information database is no easy feat. Although computer algorithms can gather a lot of data automatically, database owners additionally fix errors and fill in missing information, as well as provide search capabilities and analytical tools that allow users to navigate these vast resources. 

Existing alternatives to proprietary databases include PubMed, Crossref, OpenCitations, and OpenAlex. The last of these, established in 2022 by nonprofit OurResearch with funding from U.K. charity Arcadia Fund, has recently attracted high-profile endorsements, striking up partnerships with organizations including the French Ministry of Higher Education and Research.

But some experts raise concerns about their quality compared with the proprietary databases at this stage. In a recent analysis, Frédérique Bordignon, a researcher in bibliometrics at the School of Bridges ParisTech, found that a large chunk of the thousands of articles returned by OpenAlex for her institution were incorrectly assigned. Errors included confusing conference papers with academic articles and mixing up institution names. Commercial databases such as the Web of Science had some of these problems at inception, she says, but have eliminated many thanks to corrections provided by the institutions—work that would have to be repeated with the new databases.  

Jason Portenoy, senior data engineer at OurResearch, acknowledges this need for community input, saying it’s understandable institutions might balk at putting the work in again. “But the difference is that with OpenAlex, it is happening in the open,” he says. Any gaps in data quality are closing fast, adds OurResearch CEO Jason Priem. “OpenAlex is evolving very quickly, and so often issues uncovered by our community are fixed in a few months.” When one of the declaration’s coordinators—Ludo Waltman, scientific director at the Centre for Science and Technology Studies at Leiden University—and colleagues recently used OpenAlex to rank more than 1400 universities worldwide, they concluded that although it needs improvement, the approach yielded “surprisingly good data quality.”

Clarivate, which runs the Web of Science and helped fund OurResearch’s predecessor, ImpactStory, “broadly support[s] the aims of this declaration,” says Senior Vice President of Research and Analytics for Academia and Government Emmanuel Thiveaud. “However, we believe there is room and need for multiple perspectives. … No single approach nor single entity could address the most pressing challenges facing research.” Elsevier, which runs Scopus, says it has long backed open initiatives and welcomes “any projects that support research as we share the same goal.”  

Commercial databases can still provide value in this new landscape, Waltman says. But, “Instead of monetizing their data, [they could] shift to a new way of working in which their data is open and users instead pay for services on top of the data.” 

Daniel Hook, CEO of Digital Science, which operates the proprietary database Dimensions, welcomes this idea. (Dimensions already offers a free version for noncommercial use, though users have to subscribe to access full features.) Still, such a transition will take time, Hook says. Proprietary databases need to recover the costs of establishing, enhancing, and maintaining such large data sets—a challenge that open equivalents such as OpenAlex could also face long term.


doi: 10.1126/science.zyyid5c

domingo, 10 de diciembre de 2023

FRANCIA: Universidad de la Sorbona cancela suscripción a Web of Science

Publicado en Sorbonne University
https://www.sorbonne-universite.fr/en/news/sorbonne-university-unsubscribes-web-science


8/12/2023

La Universidad de la Sorbona se da de baja de la Web of Science

La Universidad de la Sorbona lleva muchos años profundamente comprometida con la promoción y el desarrollo de la ciencia abierta. De acuerdo con su compromiso con la información de investigación abierta, ha decidido interrumpir su suscripción a la base de datos de publicaciones Web of Science y a las herramientas bibliométricas Clarivate en 2024. Al abandonar decididamente el uso de productos bibliométricos propietarios, abre el camino a herramientas abiertas, gratuitas y participativas.

La política de ciencia abierta de la Universidad de la Sorbona se refleja en su firme postura en las negociaciones con editores comerciales, su firme apoyo al archivo abierto HAL y su fomento del acceso abierto a los datos de investigación. Al desarrollar el acceso abierto a las publicaciones y a los resultados de la investigación y permitir a su comunidad académica recuperar el control sobre los resultados de su propio trabajo y abrir la ciencia a la sociedad, la promoción de la información abierta sobre sus publicaciones y su producción científica constituye una prioridad.

Por ello, la Universidad de la Sorbona ha decidido interrumpir su suscripción a la base de datos Web of Science y a las herramientas bibliométricas de Clarivate en 2024. Además, la Universidad de la Sorbona ha decidido reorientar sus esfuerzos hacia la exploración de herramientas abiertas, gratuitas y participativas. Esta decisión está en consonancia con la política global de apertura de la Universidad, que ahora trabaja para consolidar una alternativa sostenible e internacional, en particular mediante el uso de OpenAlex.

Próximamente se firmará un acuerdo de asociación entre la Universidad de la Sorbona y OpenAlex para formalizar sus contribuciones y compromisos mutuos con el fin de mejorar la calidad de los datos relativos a la Universidad de la Sorbona y apoyar los desarrollos que respondan a las necesidades de su comunidad y, por ende, de la comunidad investigadora internacional.

Las opciones de la Universidad de la Sorbona coinciden con las del CWTS (Centro de Estudios de Ciencia y Tecnología) de Leiden, que ha anunciado que hace de la apertura de la información sobre investigación una prioridad, y trabaja actualmente en una versión totalmente transparente y reproducible de sus clasificaciones, basada en datos abiertos de CrossRef y OpenAlex.

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Sorbonne University unsubscribes from the Web of Science

Sorbonne University has been deeply committed to the promotion and the development of  open science for many years. According to its commitment to open research information, it has decided to discontinue its subscription to the Web of Science publication database and Clarivate bibliometric tools in 2024. By resolutely abandoning the use of proprietary bibliometric products, it is opening the way for open, free and participative tools.

Sorbonne University's open science policy is reflected in its firm stance in negotiations with commercial publishers, its strong support for the HAL open archive and its encouragement of open access to research data. As it is developing open access to publications and research results and enabling its academic  community to regain control over  the results of their own work and opening up science to society, promoting open research information about its publications and scientific output is a priority.

Sorbonne University has therefore decided to discontinue its subscription to the Web of Science database and Clarivate's bibliometric tools in 2024. Furthermore, Sorbonne University has decided to redirect its efforts towards the exploration of open, free and participative tools. This decision is in line with the University’s overall policy of openness, and it is now working to consolidate a sustainable, international alternative, in particular by using OpenAlex.

A partnership agreement will soon be signed between Sorbonne University and OpenAlex to formalize their mutual contributions and commitments to improve the quality of data relating to Sorbonne University and to support developments that will meet the needs of its community, and thus the international research community.

Sorbonne University's choices are in line with those of Leiden's CWTS (The Centre for Science and Technology Studies), which has announced that it is making the openness of research information a priority, and is currently working on a fully transparent and reproducible version of its rankings, based on open data from CrossRef and OpenAlex.

viernes, 28 de enero de 2022

OpenAlex: ya está aquí el sucesor de Microsoft Academic Graph con 200 millones de documentos científicos

Publicado en Nature
https://www.nature.com/articles/d41586-022-00138-y 

Se lanza un índice abierto masivo de documentos académicos

OpenAlex cataloga cientos de millones de documentos científicos y establece conexiones entre ellos.

Dalmeet Singh Chawla

Se ha lanzado un ambicioso índice gratuito de más de 200 millones de documentos científicos que cataloga las fuentes de publicación, la información de los autores y los temas de investigación.

El índice, llamado OpenAlex en honor a la antigua Biblioteca de Alejandría (Egipto), también pretende trazar conexiones entre estos puntos de información para crear una base de datos completa e interconectada del sistema de investigación mundial, dicen sus fundadores. La base de datos, que se puso en marcha el 3 de enero, sustituye a Microsoft Academic Graph (MAG), una alternativa gratuita a las plataformas por suscripción como Scopus, Dimensions y Web of Science que dejó de funcionar a finales de 2021.

"Se trata de reunir muchas bases de datos de forma inteligente", afirma Euan Adie, fundador de Overton, una empresa con sede en Londres que rastrea la investigación citada en documentos políticos. Overton había obtenido sus datos de varias fuentes, como MAG, ORCID, Crossref y directamente de los editores, pero ahora ha pasado a utilizar únicamente OpenAlex, con la esperanza de facilitar el proceso.

Mejora de la cobertura

La decisión de Microsoft de cerrar MAG (announced last May), anunciada el pasado mes de mayo, preocupó a algunos académicos y otras personas que utilizaban sus datos para realizar estudios y crear herramientas de investigación.

En respuesta al cierre de MAG, la empresa de servicios académicos sin ánimo de lucro OurResearch, de Vancouver (Canadá), creó OpenAlex, utilizando parte de una subvención de 4,5 millones de dólares de la organización benéfica londinense Arcadia Fund. Actualmente, el índice es accesible a través de una interfaz de programación de aplicaciones, o API, que puede realizar búsquedas complejas. Está previsto que en febrero se lance una interfaz de motor de búsqueda (search-engine interface) más sencilla.

OpenAlex extrae sus datos de los registros existentes de MAG y de otras fuentes, como los identificadores de Wikidata, ORCID, Crossref y ROR, dice Jason Priem, cofundador de OurResearch.

La herramienta también está integrada con la base de datos Unpaywall, que contiene más de 30 millones de artículos de acceso abierto que Priem y la cofundadora de OurResearch, Heather Piwowar, lanzaron en 2017 (launched in 2017). "Ahora tenemos una cobertura de acceso abierto mucho mejor que la que tenía MAG", dice Priem. "No solo podemos decirte dónde viven las copias de lectura libre de cualquier artículo en particular, sino que también podemos decirte la licencia y la versión de ese artículo".

Fácil de configurar

OpenAlex también es gratuito, gracias al patrocinio de Amazon Web Services, y no requiere registro ni información de acceso, lo que hace que el proceso sea más fácil de usar, dice Priem. Esto difiere de MAG, para el que los usuarios tenían que iniciar sesión en Azure, el sistema de alojamiento en la nube de Microsoft, y pagar una pequeña cuota para descargar su conjunto de datos. Priem dice que su empresa podría considerar la posibilidad de lanzar un nivel premium de pago de OpenAlex para los usuarios que quieran un acceso súper rápido, pero siempre habrá una versión actualizada y gratuita.

Está "escrito de tal manera que es muy fácil de usar", dice Adie. Añade que sólo tardó unos 20 minutos en empezar a utilizar OpenAlex, frente a los tres o cuatro días que tardaba con MAG. "El inconveniente es que Microsoft tenía mucha capacidad técnica que podía aplicar a Microsoft Academic. Así que tendremos que ver cómo le va a OurResearch sin eso", dice Adie. 

Roar Bakken Stovner, que estudia los patrones de citación de los investigadores en la Universidad Metropolitana de Oslo, dice que le llevó unas dos horas empezar a trabajar con OpenAlex, frente a una semana con MAG. "Para alguien que tenga más conocimientos informáticos, MAG puede ser más fácil", dice. "Para los investigadores que quieran probar pequeños proyectos por su cuenta, OpenAlex será mucho más fácil para empezar".

Frode Opdahl, director ejecutivo de Keenious, una empresa de nueva creación con sede en Tromsø (Noruega), que escanea millones de documentos para sugerir referencias relevantes, dice que está satisfecho con la documentación publicada sobre OpenAlex. "Hace que sea mucho más fácil trabajar con él e implementarlo en nuestro producto", afirma.


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  • 24 January 2022

Massive open index of scholarly papers launches

OpenAlex catalogues hundreds of millions of scientific documents and charts connections between them.


An ambitious free index of more than 200 million scientific documents that catalogues publication sources, author information and research topics, has been launched.

The index, called OpenAlex after the ancient Library of Alexandria in Egypt, also aims to chart connections between these data points to create a comprehensive, interlinked database of the global research system, say its founders. The database, which launched on 3 January, is a replacement for Microsoft Academic Graph (MAG), a free alternative to subscription-based platforms such as Scopus, Dimensions and Web of Science that was discontinued at the end of 2021.

“It’s just pulling lots of databases together in a clever way,” says Euan Adie, founder of Overton, a London-based firm that tracks the research cited in policy documents. Overton had been getting its data from various sources, including MAG, ORCID, Crossref and directly from publishers, but has now switched to using only OpenAlex, in the hope of making the process easier. 

Improved coverage

Microsoft’s move to close MAG, announced last May, worried some academics and others who used its data to conduct studies and build research tools.

In response to MAG’s closure, non-profit scholarly services firm OurResearch in Vancouver, Canada, created OpenAlex, using part of a US$4.5-million grant from London-based charity Arcadia Fund. The index is currently accessible through an application programming interface, or API, that can perform complex searches. A simpler search-engine interface is scheduled to launch in February.

OpenAlex draws its data from MAG’s existing records and from other sources including Wikidata identifiers, ORCID, Crossref and ROR, says Jason Priem, co-founder of OurResearch.

The tool is also integrated with the Unpaywall database, which contains more than 30 million open-access articles that Priem and OurResearch co-founder Heather Piwowar launched in 2017. “We now have much better coverage of open access than MAG ever did,” Priem says. “Not only can we tell you where the free-to-read copies of any particular article live, but we can also tell you the licence and the version of that article.”

Priem says that OpenAlex updates every fortnight by bringing in more data from its sources. The tool goes a step further towards openness than MAG did, because OpenAlex’s underlying code is freely available under a CC0 copyright licence for anyone to build on, says Priem. That means that if OpenAlex were to be discontinued, any researcher can pick up where Priem left off instead of having to rebuild the whole database from scratch.

Easy set-up

OpenAlex is also free to use, thanks to sponsorship from Amazon Web Services, and requires no registration or log-in information, making the process more user-friendly, says Priem. This differs from MAG, for which users had to log into Azure, Microsoft’s cloud-hosting system, and pay a small fee to download their data set. Priem says that his firm might consider rolling out a premium, pay-to-use tier of OpenAlex for users who want super-fast access, but a free up-to-date version will always be available.

It’s “written in such a way that’s very easy for somebody to pick up and use”, says Adie. He adds that it took him only about 20 minutes to get started on OpenAlex, compared with three to four days with MAG. “The downside is that Microsoft had a lot of technical capability that they could apply to Microsoft Academic. So we’ll have to see how OurResearch does without that,” Adie says. 

Roar Bakken Stovner, who studies researchers’ citations patterns at Oslo Metropolitan University, says that it took him around two hours to start working with OpenAlex, compared with around a week with MAG. “For somebody who is more computer savvy, MAG might be easier,” he says. “For researchers who want to try small projects on their own, OpenAlex will be way easier to start with.”

Frode Opdahl, chief executive of Keenious, a start-up firm based in Tromsø, Norway, which scans millions of papers to suggest relevant references, says he’s pleased with the documentation published about OpenAlex. “It makes it a lot easier to work with and implement into our product,” he says.

doi: https://doi.org/10.1038/d41586-022-00138-y


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"¡Quemadlo con fuego!" - El uso de ChatGPT «polariza» a los revisores

Publicado en THE Times Higher Education https://www.timeshighereducation.com/news/corrupting-chatgpt-use-polarises-peer-reviewers   Quemadlo...