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miércoles, 25 de marzo de 2026

¿Acceso abierto o extracción abierta? La cuestión de la gobernanza de los datos en el Acuerdo sobre Pandemias de la OMS

Publicado en The Brussels Times https://www.brusselstimes.com/2026292/open-access-or-open-extraction-the-data-governance-question-in-the-who-pandemic-agreement





¿Acceso abierto o extracción abierta? La cuestión de la gobernanza de los datos en el Acuerdo sobre Pandemias de la OMS


Por Tulio de Lima Campos, jefe de Bioinformática de la Fundación Oswaldo Cruz (Brasil), y Taime Sylvester, profesor titular de la Universidad de Ciencia y Tecnología de Namibia.


Martes, 17 de marzo de 2026


Cuando un paciente con síntomas respiratorios graves acudió al sistema de salud pública de Brasil durante la pandemia del SARS-CoV-2, se puso en marcha una cadena de trabajo. Una enfermera recogió la muestra. Un laboratorio público la procesó. Un equipo de bioinformática ensambló y verificó el genoma viral. Todo ello se financió con un presupuesto público limitado y lo llevaron a cabo profesionales que trabajaban bajo presión en un entorno con escasos recursos. 


La secuencia se subió a una base de datos mundial en cuestión de horas, con la esperanza de que reforzara la vigilancia, facilitara la detección de variantes y contribuyera a una respuesta global coordinada, que incluyera el acceso equitativo a las vacunas, las pruebas de diagnóstico y los tratamientos.


El problema está en lo que ocurrió después.


Sin embargo, una vez que la secuencia entró en el sistema internacional, no existía ningún mecanismo para registrar su uso posterior, como quién la descargó, a qué productos contribuyó o si algún beneficio revertiría en el sistema de salud y las comunidades que lo hicieron posible. Los datos se fueron. Los beneficios no llegaron. Esta experiencia no es exclusiva de Brasil, sino que ocurrió en Namibia, Sudáfrica y en innumerables países más, y refleja una realidad más amplia para muchos países en desarrollo que aportan datos sobre patógenos a plataformas globales.  


El Acuerdo sobre Pandemias de la OMS, adoptado en mayo de 2025, tenía por objeto cambiar esta situación. El artículo 12 establece un sistema de acceso a los patógenos y participación en los beneficios (PABS) basado en el principio de «igualdad de condiciones»: quienes acceden a los datos sobre patógenos asumen obligaciones equivalentes a las de quienes los facilitan. Que ese principio tenga algún significado depende de una cuestión aún sin resolver en las negociaciones en curso sobre el anexo del PABS: ¿se puede identificar a los usuarios, rastrear su uso y hacer cumplir sus obligaciones? Según las propuestas presentadas actualmente por varios países desarrollados, la respuesta es no.


Un sistema de distribución de beneficios requiere, como mínimo, la capacidad de identificar quién ha utilizado los datos cubiertos, con qué fin y con qué resultados. Sin el registro de los usuarios, ninguna de estas condiciones puede cumplirse. Una secuencia depositada bajo un modelo de acceso anónimo puede ser descargada por un instituto de salud pública, una empresa farmacéutica, una empresa de biotecnología o un laboratorio académico, sin que quede constancia de la transacción. No existe, por tanto, ningún mecanismo para determinar qué secuencias contribuyeron a qué productos, ninguna base para invocar las obligaciones de distribución de beneficios y ningún medio para supervisar el cumplimiento. El principio de igualdad de condiciones del artículo 12 se derrumba en el momento del acceso a los datos.


Una de las preocupaciones planteadas por los países desarrollados en las negociaciones del anexo del PABS es que exigir el registro o aceptar condiciones de acceso a los datos podría ralentizar la investigación o socavar el acceso abierto. La afirmación de que el registro es incompatible con la ciencia abierta no está respaldada por pruebas. Muchos repositorios de uso generalizado ya exigen el registro de los usuarios, la verificación de la identidad y acuerdos de acceso a los datos, al tiempo que prestan servicio a decenas de miles de investigadores en casi todos los países. Los repositorios genómicos de acceso controlado y los entornos de investigación de confianza han demostrado que es posible combinar el acceso rápido a los datos con una gobernanza sólida. Los investigadores inician sesión habitualmente en las bases de datos, aceptan las condiciones de uso y siguen realizando análisis a gran escala y urgentes.


Una segunda preocupación es que el registro y los acuerdos de acceso a los datos podrían amenazar la interoperabilidad o el intercambio de datos entre máquinas. Esta afirmación tampoco está respaldada. La interoperabilidad depende de formatos compartidos, estándares de metadatos e interfaces de programación de aplicaciones, no del anonimato de los usuarios. Los sistemas de información actuales autentican habitualmente tanto a usuarios humanos como a agentes automatizados, al tiempo que mantienen arquitecturas altamente interoperables. Esto es así en los sectores de la salud, las finanzas y otros sectores que hacen un uso intensivo de datos, y no hay ninguna razón inherente por la que las bases de datos de patógenos deban ser diferentes.  


Una tercera línea argumental invoca la Recomendación de la UNESCO sobre la ciencia abierta. Sin embargo, aunque dicho instrumento aborda el acceso abierto a los datos, también establece explícitamente que los datos no deben extraerse de forma injusta o desigual en nombre de la apertura. No prevalece sobre los derechos soberanos recogidos en el Convenio sobre la Diversidad Biológica, y no fue concebida para impedir que los países impongan condiciones razonables al uso de sus recursos biológicos. En la práctica, la ciencia abierta abarca más que la ausencia de condiciones. Aborda quién puede participar en la producción de conocimiento, quién puede utilizar los resultados y cómo se distribuyen los beneficios. Citar selectivamente a la UNESCO para argumentar en contra de cualquier condición de acceso socava los mismos principios de equidad que la Recomendación pretendía promover.


Hay un precedente histórico que merece la pena señalar. El Marco de Preparación para una Pandemia de Gripe (PIP), adoptado después de que Indonesia retuviera muestras del H5N1 en 2006 debido al acceso desigual a las vacunas, fue el primer intento de vincular el intercambio de patógenos con la distribución de beneficios. Los análisis independientes han concluido sistemáticamente que, si bien garantizó eficazmente el acceso a las muestras de virus, no logró proporcionar beneficios de manera fiable a los países proveedores, en parte porque los mecanismos que vinculaban el uso con la obligación eran demasiado débiles. El PABS se está negociando a la sombra de ese fracaso. Reproducir la misma brecha estructural sería una elección consciente, no un descuido.


La pandemia de COVID-19 puso de manifiesto las consecuencias a gran escala. A finales de 2021, los países desarrollados habían administrado una media de más de una dosis de vacuna por persona; los países en desarrollo, muchos de los cuales habían aportado datos de secuenciación a la respuesta mundial, habían administrado menos de cuatro dosis por cada cien personas.


Conviene ser precisos sobre lo que se propone, ya que a menudo se malinterpreta. Los países en desarrollo no buscan contratos bilaterales complejos para cada transacción de datos. Esto incluye a los usuarios académicos. Los laboratorios financiados con fondos públicos generan habitualmente resultados que se utilizan posteriormente en el desarrollo comercial, y excluirlos de cualquier marco de rendición de cuentas rompe la cadena de trazabilidad entre los datos públicos y el producto privado. Lo que se pide es un marco estandarizado y sin trabas que se aplique a todos los usuarios: registro con afiliación institucional verificada, un acuerdo estándar de acceso a los datos que establezca obligaciones de transparencia y participación en la distribución de beneficios, y una capacidad básica de seguimiento para rastrear cómo se utilizan los datos etiquetados con PABS y en qué sectores.


No se trata de condiciones novedosas. En la Unión Europea, los acuerdos de transferencia de material y los acuerdos de acceso a datos regulan el intercambio de materiales biológicos y datos sensibles como práctica habitual. Las normas de aplicación del Protocolo de Nagoya definen los términos mutuamente acordados como acuerdos contractuales para la distribución de beneficios. Las mismas normas de gobernanza que los países desarrollados aplican a nivel nacional para proteger sus propios datos genómicos son precisamente las que los países en desarrollo solicitan que se extiendan a los datos procedentes de sus hospitales, laboratorios y comunidades.  


Un grupo de aproximadamente un centenar de países en desarrollo ha abogado sistemáticamente por el reparto obligatorio de beneficios —incluido el acceso garantizado a vacunas, tratamientos y pruebas de diagnóstico— como condición para el intercambio rápido de datos sobre patógenos. Esa postura refleja una valoración compartida, basada en la experiencia de la COVID-19, de lo que supone en la práctica un sistema sin una trazabilidad exigible. La sesión del Grupo de Trabajo Intergubernamental de la OMS, que se celebrará del 23 al 28 de marzo, es la última ronda prevista antes de que el anexo del PABS se presente a la Asamblea Mundial de la Salud. Las plataformas existentes demuestran que la ciencia abierta y la gobernanza responsable de los datos son compatibles; la cuestión es si los negociadores incorporarán esa compatibilidad en el anexo. El registro de usuarios, los acuerdos de acceso a los datos y la capacidad de seguimiento no son obstáculos para un sistema PABS funcional. Son precisamente lo que lo hace posible.

AIDS Healthcare Foundation (AHF)


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Open access or open extraction? The data governance question in the WHO Pandemic Agreement


By Tulio de Lima Campos, Head of Bioinformatics at the Oswaldo Cruz Foundation (Brazil), and Taime Sylvester, Senior Lecturer at the Namibia University of Science and Technology.


Tuesday, 17 March 2026


When a patient with severe respiratory symptoms arrived in Brazil’s public health system during the SARS-CoV-2 pandemic, a chain of work followed. A nurse collected the sample. A public laboratory processed it. A bioinformatics team assembled and checked the viral genome. All of this was funded through a constrained public budget and carried out by professionals working under pressure in an under‑resourced setting. 


The sequence was uploaded to a global database within hours, in the expectation that it would strengthen surveillance, support variant detection and contribute to a coordinated global response, which included equitable access to the vaccines, diagnostic tests and therapeutics.


What happened next is the problem.


Once the sequence entered the international system, however, there was no mechanism to record its downstream use, such as who downloaded it, which products it contributed to, or whether any benefit would return to the health system and communities that made it possible. The data left. The benefits did not follow. This experience is not unique to Brazil, it happened to Namibia, South Africa, and countless other countries, and it reflects a broader reality for many developing countries that contribute pathogen data to global platforms.  

 

The WHO Pandemic Agreement, adopted in May 2025, was meant to change this. Article 12 establishes a Pathogen Access and Benefit-Sharing (PABS) system on an "equal footing" principle: those who access pathogen data carry obligations matching those who provide it. Whether that principle means anything depends on one unresolved question in the ongoing PABS Annex negotiations: can users be identified, their use traced, and their obligations enforced? Under proposals currently advanced by several developed countries, the answer is no.


A benefit-sharing system requires, at minimum, the capacity to identify who has used covered data, for what purpose, and with what outcomes. Without user registration, none of these conditions can be met. A sequence deposited under an anonymous-access model can be downloaded by a public health institute, a pharmaceutical company, a biotechnology firm, or an academic laboratory, with no record of the transaction. There is then no mechanism to determine which sequences contributed to which products, no basis for invoking benefit-sharing obligations, and no means of monitoring compliance. The equal footing principle of Article 12 collapses at the point of data access.


One concern raised by developed countries in the PABS Annex negotiations is that requiring registration or accepting data‑access terms could slow research or undermine open access. The claim that registration is incompatible with open science is not supported by evidence. Many widely used repositories already require user registration, identity verification, and data-access agreements, while serving tens of thousands of researchers in nearly all countries. Controlled-access genomic repositories and trusted research environments have demonstrated that it is possible to combine rapid data access with robust governance. Researchers routinely log into databases, accept terms of use and still conduct time‑sensitive, large‑scale analyses.


A second concern is that registration and data-access agreements could threaten interoperability or machine‑to‑machine data exchange. This claim is similarly unsupported. Interoperability is a function of shared formats, metadata standards, and application programming interfaces, not of user anonymity. Contemporary information systems routinely authenticate both human users and automated agents while maintaining highly interoperable architectures. This is true in health, finance and other data‑intensive sectors, and there is no inherent reason pathogen databases should be different.   


​A third line of argument invokes the UNESCO Recommendation on Open Science. However, although that instrument addresses open access to data, it also states explicitly that data should not be unfairly or inequitably extracted in the name of openness. It does not override sovereign rights under the Convention on Biological Diversity, and it was not designed to prevent countries from attaching reasonable conditions to the use of their biological resources. In practice, open science encompasses more than the absence of conditions. It addresses who can participate in knowledge production, who can use the outputs and how benefits are distributed. Selectively citing UNESCO to argue against any access conditions undermines the very equity principles the Recommendation was designed to advance.  


There is a historical precedent worth noting. The Pandemic Influenza Preparedness (PIP) Framework, adopted after Indonesia withheld H5N1 samples in 2006 over inequitable vaccine access, was the first attempt to link pathogen sharing with benefit-sharing. Independent analysis has consistently found that, while it effectively secured access to virus samples, it failed to reliably deliver benefits to provider countries, in part because the mechanisms linking use to obligation were too weak. PABS is being negotiated in the shadow of that failure. Reproducing the same structural gap would be a conscious choice, not an oversight. 


The COVID-19 pandemic illustrated the consequences at scale. By late 2021, developed countries had administered more than one vaccine dose per person on average; developing countries, many of which had contributed sequence data to the global response, had administered fewer than four doses per hundred people.


It is worth being precise about what is being proposed, because it is frequently mischaracterized. Developing countries are not seeking complex bilateral contracts for every data transaction. This includes academic users. Publicly funded laboratories routinely generate findings used downstream in commercial development, and excluding them from any accountability framework breaks the chain of traceability between public data and private product. What is being asked for is a standardized, low-friction framework that applies to all users: registration with verified institutional affiliation, a standard data-access agreement setting out transparency obligations and benefit-sharing participation, and basic monitoring capacity to track how PABS-tagged data are used and in which sectors.


These are not novel conditions. Within the European Union, material transfer agreements and data-access agreements govern the exchange of biological materials and sensitive data as standard practice. Nagoya Protocol implementing regulations define mutually agreed terms as contractual arrangements for benefit-sharing. The same governance norms that developed countries apply domestically to protect their own genomic data are precisely what developing countries are asking to be extended to data originating from their hospitals, laboratories, and communities. 


A bloc of approximately a hundred developing countries has consistently called for mandatory benefit-sharing, including guaranteed access to vaccines, therapeutics, and diagnostics, as a condition of rapid pathogen data sharing. That position reflects a shared assessment, informed by the COVID-19 experience, of what a system without enforceable traceability produces in practice.


The March 23–28 session of the WHO Intergovernmental Working Group is the last scheduled round before the PABS Annex goes to the World Health Assembly. Existing platforms demonstrate that open science and accountable data governance are compatible—the question is whether negotiators will build that compatibility into the Annex. User registration, data-access agreements, and monitoring capacity are not obstacles to a functional PABS system. They are what make one possible.


AIDS Healthcare Foundation (AHF)


jueves, 16 de octubre de 2025

U.S.A.: las revistas en la mira. La Admón. Trump abandera la crítica contra la corrupción de la industria editorial y farmacéutica... para imponer su propia agenda

Publicado en Inside Higher Ed
https://www.insidehighered.com/news/government/science-research-policy/2025/10/02/scientific-publishing-industry-faces-federal?utm_source=Inside+Higher+Ed&utm_campaign=011cae14d5-DNU_2021_COPY_02&utm_medium=email&utm_term=0_1fcbc04421-011cae14d5-236508634&mc_cid=011cae14d5&mc_eid=500f40f791 



2 de octubre de 2025


Las revistas científicas en el punto de mira


Las autoridades federales están planteando preocupaciones de larga data sobre las revistas de investigación y las estructuras de incentivos académicos que las sustentan. Pero los expertos afirman que el Gobierno por sí solo no puede reformar el sector.


Por  Kathryn Palmer


Las críticas de larga data a las publicaciones académicas están contribuyendo a alimentar los ataques de la Administración Trump contra la empresa científica del país.


Durante años, algunos miembros de la comunidad científica han dado la voz de alarma sobre el fraude en la investigación, las fábricas de artículos, la escasez de revisores cualificados y el alto coste de las suscripciones a revistas académicas y las tarifas de acceso abierto. Las investigaciones también sugieren que esos problemas tienen su origen en las estructuras de incentivos académicos que recompensan a los científicos por publicar un gran volumen de artículos en revistas muy citadas. 


En los últimos meses, Robert F. Kennedy Jr., secretario del Departamento de Salud y Servicios Humanos, y Jayanta Bhattacharya, director de los Institutos Nacionales de Salud, han puesto en el punto de mira a la industria editorial científica, cambiando políticas y utilizando sus plataformas para expresar sus propias críticas. Se han comprometido a abordar las preocupaciones sobre el sesgo, la desinformación y el acceso. En agosto, Bhattacharya escribió en un memorándum que parte de su estrategia para reconstruir la confianza del público en la ciencia incluirá centrarse en «investigaciones replicables, reproducibles y generalizables» como «la base de la verdad en la ciencia biomédica». La cultura de «publicar o perecer», añadió, «favorece la promoción de solo los resultados favorables, y el trabajo de replicación es poco valorado o recompensado».


Aunque numerosos expertos entrevistados por Inside Higher Ed afirmaron que algunas de las quejas del Gobierno sobre las publicaciones científicas son reales, se muestran escépticos sobre que las soluciones propuestas hasta ahora por el HHS y los NIH vayan a dar lugar a reformas significativas. Y uno de ellos advirtió que la Administración Trump, que sigue promoviendo la desinformación sobre las vacunas, entre otras cosas, está explotando esa realidad para promover su propia agenda ideológica.


«Todos sabemos que la ciencia y las publicaciones científicas se enfrentan a enormes problemas. Pero gran parte de la comunidad científica finge que no hay ningún problema», afirma Luís A. Nunes Amaral, profesor de ingeniería de la Universidad Northwestern y coautor de un artículo que identificó un aumento de los fraudes en la investigación durante los últimos 15 años. «Esta actitud empodera a los demagogos para que luego vengan y señalen problemas que son reales y reconocibles. Esto les da cierta sensación de [legitimidad], pero en realidad no están tratando de mejorar las cosas, sino de destruirlas».


Además de cancelar cientos de subvenciones de investigación del NIH que no se ajustan a las opiniones ideológicas de la administración Trump y proponer recortar el 40 % del presupuesto del NIH, el intento de la administración de reformar las publicaciones académicas podría acabar dando al Gobierno más control sobre las revistas que durante mucho tiempo han actuado como guardianas de la investigación científica validada.


«Completamente corrupto» 


Incluso antes de convertirse en el máximo responsable de salud pública del país a principios de este año, Kennedy calificó a varias revistas médicas de prestigio, entre ellas The New England Journal of Medicine y The Lancet, de «absolutamente corruptas», y afirmó durante su campaña presidencial de 2024 que quería emprender acciones legales contra ellas. Aunque todavía no ha demandado a ninguna revista, en mayo el secretario del HHS amenazó con prohibir a los científicos financiados por el Gobierno publicar en esas y otras revistas, alegando que están controladas por la industria farmacéutica.


La influencia de la industria farmacéutica es una preocupación que también han planteado los editores de revistas médicas. En 2009, Marcia Angell, antigua redactora jefe de NEJM, escribió que los vínculos financieros de los investigadores con las empresas farmacéuticas hacían que «ya no fuera posible creer gran parte de la investigación clínica que se publica».


Sin embargo, en un artículo de opinión publicado por STAT en junio, Angell y otros dos antiguos editores del NEJM explicaron que las revistas no crearon el problema, sino que los investigadores han llegado a depender del apoyo de las empresas farmacéuticas. No obstante, señalaron que las revistas han tomado medidas para mitigar la influencia de la industria, entre ellas exigir a los autores que revelen sus vínculos con las empresas pertinentes.


«Kennedy tiene razón al afirmar que la dependencia de la investigación médica de la financiación farmacéutica es un problema», escribieron los antiguos editores. «Pero las medidas de Kennedy como director del HHS, entre ellas los profundos recortes a los Institutos Nacionales de Salud y los ataques a nuestras mejores revistas médicas, agravarán ese problema».


Kennedy también ha planteado la idea de lanzar una revista gubernamental interna como solución para erradicar la corrupción. Pero Ivan Oransky, investigador médico y cofundador de Retraction Watch, dijo que eso también podría plantear dudas sobre la credibilidad.


«No estoy muy seguro de qué se consigue con la creación de una revista. No es más que otra revista que tendrá que competir con otras revistas», afirmó. «La otra pregunta es: ¿será imparcial y equilibrada? ¿Se interesará por la verdad y por difundir la buena ciencia o solo por la ciencia que [Kennedy] considera que vale la pena? Es un temor real, dadas muchas de sus declaraciones y lo que está tratando de hacer».


(Kennedy ha defendido numerosas afirmaciones médicas sin fundamento o desacreditadas, entre ellas que las vacunas causan autismo).


«Un desastre total»


Aunque Oransky reconoció que las publicaciones académicas son efectivamente «un desastre total» que «fomentan incentivos terribles que dificultan la confianza en toda la literatura científica», afirmó que «reorganizar las tumbonas del Titanic» no solucionará nada.


«El NIH es una importante fuente de financiación de la investigación, así que ¿por qué no cambian sus incentivos?», dijo. «Podrían cambiar el sistema de revisión por pares del NIH para que nadie privilegie las citas y las revistas de alto impacto».


Kennedy no es el único que ha cuestionado la integridad de las revistas médicas.


En abril, el entonces fiscal interino del Distrito de Columbia, Edward R. Martin Jr., envió cartas a numerosas revistas, entre ellas The Journal of the American Medical Association y CHEST (una revista publicada por el Colegio Americano de Médicos del Tórax), cuestionándolas por lo que él denominó sesgo político.


Y antes de asumir su cargo, Bhattacharya y Martin Kulldorff, un antiguo bioestadístico de la Universidad de Harvard, lanzaron su propia revista, The Journal of the Academy of Public Health, vinculada al sitio web de noticias de derecha RealClearPolitics, como contrapunto a las revistas convencionales. Durante la pandemia, Bhattacharya y Kulldorff fueron coautores de la Declaración de Great Barrington, que instaba a los responsables de salud pública a reducir las recomendaciones de confinamiento destinadas a mitigar la propagación de la enfermedad y que recibió críticas generalizadas por parte de los responsables de los NIH en ese momento. A los críticos les preocupa que la nueva revista se convierta en una plataforma para algunas de las investigaciones dudosas impulsadas por la administración Trump.


Dejando a un lado las preocupaciones políticas, la revista presume de pagar a los revisores y de ofrecer todo su contenido de forma gratuita, políticas que algunos defensores de la ciencia también han pedido que implementen más revistas. En julio, los NIH aceleraron la implementación de una política de la era Biden que exige a los investigadores financiados con fondos federales que depositen su trabajo en repositorios de acceso público designados por la agencia, incluido el PubMed Central, gestionado por los NIH, inmediatamente después de su publicación.


Pero abrir el acceso a la investigación científica no será suficiente para restaurar la confianza del público en la ciencia, afirmó Meagan Phelan, directora de comunicaciones de la familia de revistas Science.


«Si tu objetivo es recuperar la confianza del público, también tienes que escuchar las áreas de interés y preocupación públicas», afirmó, señalando que el proceso científico no siempre es bien comprendido por el público en general. «¿Qué tipo de cosas harán, además de publicar, para escuchar realmente las preocupaciones del público y ayudar a recuperar su confianza? No es tan sencillo como simplemente hacer que todo esto sea gratuito».


Como directora de los NIH, Bhattacharya también se ha comprometido a controlar la industria editorial académica con fines lucrativos, valorada en 19 000 millones de dólares, que los académicos, que suelen escribir y revisar artículos sin recibir compensación alguna, llevan mucho tiempo criticando por considerarla explotadora. En julio, los NIH propusieron limitar los gastos de procesamiento de artículos (APC) que algunas revistas cobran a los investigadores para que sus publicaciones sean de libre acceso, y que pueden oscilar entre cientos y miles de dólares.  


Bhattacharya ha afirmado que la medida tiene como objetivo acabar con los «incentivos perversos» que enriquecen a la industria editorial y hacer que «sea mucho más difícil para una pequeña élite científica decidir qué es verdad y qué es mentira».


Los científicos deben liderar la reforma


Aunque los científicos y los defensores del acceso abierto también han criticado los APC, varios afirman que no creen que el plan del NIH de implementar un límite artificial sea una estrategia lo suficientemente completa como para reformar las estructuras de incentivos académicos o de publicación científica.  


«Hoy en día, la publicación es un sistema muy complicado que tiene muchos objetivos entrelazados y contrapuestos. No es fácil cambiar una palanca y pensar que va a tener el efecto que queremos», afirma Jennifer Trueblood, directora del programa de ciencias cognitivas de la Universidad de Indiana en Bloomington. «A primera vista, limitar los APC puede parecer lógico para mucha gente. Pero, ¿cómo respondería una editorial comercial a eso? Podrían simplemente trasladar los costes a las bibliotecas y los lectores».


En cuanto a la reforma de las estructuras de incentivos que incitan a algunos científicos a publicar investigaciones defectuosas, el NIH tampoco podrá hacerlo por sí solo.


«El cambio debe ser liderado por los científicos», afirma Trueblood. «Las instituciones académicas deben replantearse cómo evalúan a los científicos y asegurarse de que esa evaluación no alimenta un sistema que apoya la publicación comercial». 


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October 02, 2025

Scientific Journals in the Hot Seat

Federal officials are raising long-standing concerns with research journals and the academic incentive structures propping them up. But experts say the government alone can’t overhaul the industry.

By  Kathryn Palmer


Long-standing criticisms of academic publishing are helping to fuel the Trump administration’s attacks on the nation’s scientific enterprise.

For years, some members of the scientific community have raised alarm about research fraud, paper mills, a paucity of qualified peer reviewers and the high cost of academic journal subscriptions and open-access fees. Research also suggests those problems are rooted in academic incentive structures that reward scientists for publishing a high volume of papers in widely cited journals. 

In recent months, Robert F. Kennedy Jr., secretary of the Department of Health and Human Services, and Jayanta Bhattacharya, director of the National Institutes of Health, have taken aim at the scientific publishing industry, changing policies and using their platforms to lodge their own criticisms. They’ve pledged to address concerns about bias, misinformation and access. In August, Bhattacharya wrote in a memo that part of his strategy to rebuild public trust in science will include focusing on “replicable, reproducible, and generalizable research” as “the basis for truth in biomedical science.” The “publish or perish” culture, he added, “favors the promotion of only favorable results, and replication work is little valued or rewarded.”

While numerous experts Inside Higher Ed interviewed said some of the government’s grievances about scientific publishing are real, they’re skeptical that the solutions the HHS and NIH have proposed so far will yield meaningful reforms. And one warned that the Trump administration—which continues to promote misinformation about vaccines, among other things—is exploiting that reality to further its own ideological agenda.  

“We all know there are enormous problems facing science and scientific publishing. But a lot of the scientific community is pretending there are no problems,” said Luís A. Nunes Amaral, an engineering professor at Northwestern University who co-authored a paper that identified a surge in research fraud over the past 15 years. “This attitude empowers demagogues to then come and point out issues that are real and recognizable. This gives them some sense of [legitimacy], but in reality they are not trying to improve things; they are trying to destroy them.”

In addition to terminating hundreds of NIH research grants that don’t align with the Trump administration’s ideological views and proposing to cut 40 percent of the NIH’s budget, the administration’s quest to reshape academic publishing could end up giving the government more control over journals that have long acted as the gatekeepers of validated scientific research.

‘Utterly Corrupt’  

Even before he became the nation’s top public health official earlier this year, Kennedy characterized multiple top medical journals, including The New England Journal of Medicine and The Lancet, as “utterly corrupt,” saying during his 2024 presidential campaign that he wanted to take legal action against them. Although he hasn’t sued any journals yet, as HHS secretary Kennedy threatened in May to bar government-funded scientists from publishing in those and other journals, claiming that they are controlled by the pharmaceutical industry.

Influence from the pharmaceutical industry is a concern editors of medical journals have also raised. In 2009, Marcia Angell, former editor in chief of NEJM, wrote that researchers’ financial ties to pharmaceutical companies made it “no longer possible to believe much of the clinical research that is published.”    

However, in an opinion article STAT published in June, Angell and two other former NEJM editors explained that journals didn’t create the issue, but researchers have come to rely on support from pharmaceutical companies. However, they noted that journals have taken steps to mitigate industry influence, including requiring authors to disclose ties to relevant companies.

“Kennedy is right that the dependence of medical research on pharmaceutical funding is a problem,” the former editors wrote. “But Kennedy’s actions as head of HHS—including his deep cuts to the National Institutes of Health and targeting of our best medical journals—will make that problem worse.” 

Kennedy has also floated the idea of launching an in-house government journal as a solution to rooting out corruption. But Ivan Oransky, a medical researcher and cofounder of Retraction Watch, said that could also raise credibility questions. 

“I’m not quite sure what creating a journal accomplishes. It’s just another journal that will have to compete with other journals,” he said. “The other question is, will it be fair and balanced? Will it be interested in what’s true and getting good science out there or only in science that [Kennedy] believes is worthwhile? That’s a real fear given a lot of his pronouncements and what he’s trying to do.”

(Kennedy has espoused numerous unsubstantiated or debunked medical claims, including that vaccines cause autism.)  

‘Hot Mess’

While Oransky acknowledged that academic publishing is indeed a “hot mess” that “encourages awful incentives that make it difficult to trust all of the scientific literature,” he said, “Rearranging deck chairs on the Titanic” won’t fix anything.

“The NIH is a major funder of research, so why don’t they change their incentives?” he said. “They could change the peer-review system at the NIH so that nobody privileges citations and high-impact-factor journals.”

Kennedy isn’t the only one who’s questioned the integrity of medical journals. 

In April, then-interim U.S. attorney for the District of Columbia Edward R. Martin Jr. sent letters to numerous journals, including The Journal of the American Medical Association and CHEST (a journal published by the American College of Chest Physicians), questioning them about what he called political bias.

And before taking his post, Bhattacharya and Martin Kulldorff, a former Harvard University biostatistician, launched their own journal—The Journal of the Academy of Public Health, which is linked to the right-wing news site RealClearPolitics—as a counter to mainstream journals. During the pandemic, Bhattacharya and Kulldorff co-authored the Great Barrington Declaration, which called on public health officials to scale back stay-at-home recommendations aimed at mitigating the spread of disease and received widespread criticism from NIH officials at the time. Critics worry that the new journal may become a platform for some of the dubious research pushed by the Trump administration. 

Political concerns aside, the journal touts that it pays peer reviewers and makes all of its content freely available—policies some science advocates have also called for more journals to implement. In July, the NIH sped up the implementation of a Biden-era policy that requires federally funded researchers to deposit their work into agency-designated public-access repositories, including the NIH-run PubMed Central, immediately upon publication.

But opening access to scientific research won’t be enough to restore public trust in science, said Meagan Phelan, communications director for the Science family of journals. 

“If your goal is to restore public trust, you also have to listen to areas of public interest and concern,” she said, noting that the scientific process isn’t always well understood by the general public. “What kinds of things will they do alongside publishing to really listen to public concern and help restore public trust? It’s not as simple as just making this stuff free.”

As NIH director, Bhattacharya has also pledged to rein in the $19 billion for-profit academic publishing industry, which academics, who typically author and peer review articles without compensation, have long criticized as exploitative. In July, the NIH proposed capping the article processing charges (APCs) some journals levy on researchers to make their publications freely available, which can range from hundreds to thousands of dollars.  

Bhattacharya has said the move is aimed at both ending the “perverse incentives” enriching the publishing industry and making it “much harder for a small number of scientific elite to say what’s true and false.”

Scientists Need to Lead Reform

While scientists and open-access advocates have also criticized APCs, several say they don’t think the NIH’s plan to implement an artificial cap is a comprehensive enough strategy to reform scientific publishing or academic incentive structures.

“Publishing now is a really complicated system that has a lot of competing, intertwined goals. It’s not easy to change one lever and think it’s going to have the effect that we want,” said Jennifer Trueblood, director of the cognitive science program at Indiana University at Bloomington. “On the surface, capping APCs may make sense to a lot of people. But how would a commercial publisher respond to that? They could easily just shift costs back to libraries and readers.”

And as for reforming the incentive structures tempting some scientists to publish faulty research, the NIH won’t be able to do that alone, either.

“A change needs to be led by scientists,” Trueblood said. “Academic institutions need to rethink how they’re evaluating scientists and making sure that evaluation isn’t feeding into a system that is supporting commercial publishing.”



IRÁN denuncia ataques de EU e Israel contra 30 universidades

Publicado en  La Jornada https://www.jornada.com.mx/noticia/2026/04/04/mundo/iran-denuncia-ataques-de-eu-e-israel-contra-30-universidades-y-...